Området er en del av Middelalderbyen Bergen og har strukturer, i hovedsak øst for Strandgaten, fra før 1650 som i dag er fredet middelalder-grunn. Over bakken finnes sporene i form av steinkjellere, og gatene Cort Piil smuget, Ytre Markevei, Hennebysmuget og Gamle Strandgaten er restene etter det selvgrodde middelalderske gatenettet. Av bygningsspor over bakken er også ruinene av bispegården synlig i tilknytning til Nykirken, og bygårdsanlegget Nøstegaten 39-45 helt sydøst i området, som er erklært automatisk fredet siden bygningene har stående konstruksjoner som kan dateres til før 1650.
Munkeliv kloster ble grunnlagt av kong Øystein Magnusson på 1100-tallet. Klosteret tilhørte benediktinerorden og var muligens det største klosteret i landet på den tiden. Etter at klosteret brente og ble revet i 1536 ble området liggende åpent, og plassen fikk navnet Klosteret.
I hundreårene mellom 1700 og 1880 er det relativt stor byggeaktiviteten på Nordnes. Det finnes en del sjøboder fra tiden, og den småskala trebebyggelsen som finnes på Nordnes stammer i hovedsak fra tiden opp til 1880. Av større bygninger og anlegg bygget på denne tiden finnes Corps de Garde, Nykirken og Klosteret (i dag Hordaland Kunstsenter).
Nykirken er gjenreist etter en brann i 1763. Underetasjen består delvis av murer fra middelalderens erkebispegård, og murene over inneholder sannsynligvis delvis murene fra kirkebyggene fra 1621 og 1623. Kirken brant i 1800 og 1944, og ble gjeninnviet i 1956 etter restaurering ved Fredrik Konow Lund.
Fra 1916 og fram til siste verdenskrig finnes en del kaianlegg, samt et viktig funksjonalistisk byggverk, Kalmarhuset, som ligger der delområdet Nordnes grenser inn mot 1916 – området. Kalmarhuset er en karakteristisk bygning tegnet av Leif Grung i 1936 og målbærer flere typiske funksjonalistiske elementer.