Opp gjennom årene har det vore gjort rekke funn frå Borgund kaupangne i forbindelse med arkeologiske undersøkingar. Det er gjennom utgravingenen av området er det funne 45000 gjenstandar, huskontrukjsonar, brønner, brygger, vegar og graver frå vikingtid og mellomalderen. Middelaldermusset på Bogrundkaupangen er eit overbygg over ein del av eit opphavleg arkeologisk utgravingsfeltet. Inne museet kan vi sjå rester av hus, brønner og stier slik dei låg under den tidlege mellomalderen. I området utanfor museet kan ein sjå fleire rekker med trestolper. Desse vart satt ned av arkeologar på 1980-talet for vise kor det var funne stolper til bygningskonstruksjonar. Foreløpig kan vi berre spekulere i om det til dømes har vore lagerhus eller fiskehjell, men forsking på feltet foregår.