Lokaliseringen av kirkestedet er uavklart. Bakgrunn for grov lokalisering er dette: LÅGØY, gnr. 22 Lågøy (Solund sogn). Kirken skal ha stått rett sør for havnebebyggelsen i Lågøyvågen, på bnr. 1 under (gnr. 22) Lågøy. Lokaliteten er inntil/rett sørøst for gammeltunet, på en liten knatt i et ”dalføre” som går mellom Lågøyvågen og Lågøysundet. Det er ikke gjort funn av skjelettrester eller tuft i dette området (Aaraas & al 2000b:51f, Buckholm 1998:27, 43). I første halvdel av 1300-tallet er kirken oppført som Cappellan j La øy hhv. Præster tækr j La øy (BK 56b), men uten at det ble ført spesifiserte inntekter, og den er ikke oppført i registeret samme sted. Ut fra diplomet av 1291 (DN XII:14) kan det se ut til at det er kong Erik Magnusson selv som har reist kirken på Lågøy (En hwar sem swa fær om at mistyrmir kappellona er gudhi er gor edha þui sem hon hefuir at vardueita, DN XII:14) – eller det er bygd av munkene fra Munkelivs kloster som da eide gården (jf. Bendixen 1903:160). Stedet der kirken skal ha stått kalles Kyrkjehaugen og rett ved ligger Kyrkjeberget.