I 1822 ble det gamle Malnes kirkested bestemt flyttet ei drøy mil sørover til (gnr 66) Eidet i bunn av Malnesfjorden. Den gamle kirkegården på Malnes var i bruk fram til 1900. Ny kirkegård ble i 1905 etablert på (50/21) Hovden, nabogård til Malnes (Straume 1964:345f). Om lag 500 m sørøst for kirkegården på Hovden heter det Kjerkhaugen, på gnr. 51/1. Innunder denne åsen, ved dens vestende, ligger et nær rektangulært område innhegnet med steingard – muligens kan dette være det middelalderske kirkestedet, jf. ID 156386, hvor Malnes stavkirke 1 og Malnes kirke 2 sto. Malnes kirke 3 har stått på samme sted som dagens kirke, Malnes kirke 4.