Dagens kirkested på Misvær ble opprettet i 1912, da den nåværende kirken sto ferdig. Lokaliteten Misvær kirkested inneholder, foruten registreringen av dagens kirke på Misvær, en registreringen av et middelaldersk korshus (Misvær kirke 1) som ikke er lokalisert. Korshuset skal ha stått på gården Misværs grunn frem til 1720, da bygningen ble revet og kirkestedet nedlagt.